Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LRP1Q07954 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms