Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FMODQ06828 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FMODQ06828 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FMODQ06828 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FMODQ06828 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FMODQ06828 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms