Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD51Q06609 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms