Protein–RNA interactions for Protein: Q06063

DUS4, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+], yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS4Q06063 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt2.49□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.49□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 SNC1YAL030W 354 nt2.49□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.49□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YBR174CYBR174C 315 nt2.49□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YBR277CYBR277C 402 nt2.49□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 SPO21YOL091W 1830 nt2.49□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 CSF1YLR087C 8877 nt2.48□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 SCD5YOR329C 2619 nt2.48□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YOR102WYOR102W 351 nt2.48□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.48□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 RRP6YOR001W 2202 nt2.48□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 NCA2YPR155C 1851 nt2.48□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 STB4YMR019W 2850 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 UBP15YMR304W 3693 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YDL196WYDL196W 330 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 EMP24YGL200C 612 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YJL022WYJL022W 309 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 SPO75YLL005C 2607 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 NIP100YPL174C 2607 nt2.47□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 LYS14YDR034C 2373 nt2.46□□□□□ -2.01
DUS4Q06063 RPS25BYLR333C 327 nt2.46□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 TOP2YNL088W 4287 nt2.46□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 BNR1YIL159W 4128 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YDR239CYDR239C 2364 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 MNE1YOR350C 1992 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 SVL3YPL032C 2478 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 SLM1YIL105C 2061 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 PMP2YEL017C-A 132 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 ACB1YGR037C 264 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YHR217CYHR217C 462 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 LCL1YPL056C 306 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 SPO22YIL073C 2928 nt2.45□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 FIR1YER032W 2631 nt2.44□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 FIG4YNL325C 2640 nt2.44□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 ESC1YMR219W 4977 nt2.43□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 CRS5YOR031W 210 nt2.43□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.43□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 SET2YJL168C 2202 nt2.43□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 AIM44YPL158C 2277 nt2.43□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 SGM1YJR134C 2124 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YCR043CYCR043C 384 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YJL120WYJL120W 324 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 PAU8YAL068C 363 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 PAU18YLL064C 363 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 PAU6YNR076W 363 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 PAU20YOL161C 363 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 UTP22YGR090W 3714 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 SMY2YBR172C 2223 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 RLM1YPL089C 2031 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 SDC25YLL016W 3147 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 RGA2YDR379W 3030 nt2.42□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 TFC3YAL001C 3483 nt2.41□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 YDR341CYDR341C 1824 nt2.41□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 PAU3YCR104W 375 nt2.41□□□□□ -2.02
DUS4Q06063 RPS17AYML024W 411 nt2.4□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.4□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 YCL046WYCL046W 324 nt2.4□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 MLH1YMR167W 2310 nt2.4□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 ZRG8YER033C 3231 nt2.4□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 KRE33YNL132W 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 FAR11YNL127W 2862 nt2.39□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 RPS29AYLR388W 171 nt2.39□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 YBR099CYBR099C 384 nt2.39□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 YEF3YLR249W 3135 nt2.38□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 ANS1YHR126C 480 nt2.38□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 MGM1YOR211C 2646 nt2.38□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 PIP2YOR363C 2991 nt2.38□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 AHC1YOR023C 1701 nt2.37□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 SIR4YDR227W 4077 nt2.37□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 HOS4YIL112W 3252 nt2.37□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 PBY1YBR094W 2262 nt2.37□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 INO80YGL150C 4470 nt2.37□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 DNF1YER166W 4716 nt2.37□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 SAC3YDR159W 3906 nt2.36□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 ZRG17YNR039C 1818 nt2.36□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 IRR1YIL026C 3453 nt2.36□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 ZIP2YGL249W 2115 nt2.36□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 EDS1YBR033W 2760 nt2.36□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 SBE22YHR103W 2559 nt2.35□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 KIP1YBL063W 3336 nt2.35□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.35□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 SAS3YBL052C 2496 nt2.35□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 GYP5YPL249C 2685 nt2.35□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 IRA2YOL081W 9240 nt2.34□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.34□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 YPL044CYPL044C 549 nt2.34□□□□□ -2.03
DUS4Q06063 HAL9YOL089C 3093 nt2.34□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 DCP2YNL118C 2913 nt2.34□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 ZIP1YDR285W 2628 nt2.34□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 RAD34YDR314C 2079 nt2.33□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 TRA1YHR099W 11235 nt2.33□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 RPL31AYDL075W 342 nt2.33□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 VPS13YLL040C 9435 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 NOC3YLR002C 1992 nt2.32□□□□□ -2.04
DUS4Q06063 CDC53YDL132W 2448 nt2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.2 ms