Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEUP1Q05D60 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368.5 ms