Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTDSPL2Q05D32 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms