Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TNP2Q05952 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms