Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNB3Q05901 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms