Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCDQ05655 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms