Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF11Q05519 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms