Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.21□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YPR063CYPR063C 423 nt1.21□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 SPO23YBR250W 1572 nt1.21□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 SMC4YLR086W 4257 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 ATG31YDR022C 591 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YDR157WYDR157W 402 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 CYC7YEL039C 342 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YHL041WYHL041W 450 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YAR047CYAR047C 321 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 BSC3YLR465C 309 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 TIM18YOR297C 579 nt1.2□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YDL211CYDL211C 1119 nt1.19□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 RPL9BYNL067W 576 nt1.19□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YOR053WYOR053W 342 nt1.19□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 LYS14YDR034C 2373 nt1.19□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 RTR1YER139C 681 nt1.18□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.18□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 SEC5YDR166C 2916 nt1.17□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 SGO1YOR073W 1773 nt1.17□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YKL083WYKL083W 615 nt1.17□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.17□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 VPS54YDR027C 2670 nt1.17□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 NUT1YGL151W 3399 nt1.16□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YLL054CYLL054C 2532 nt1.16□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 SWI4YER111C 3282 nt1.16□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.16□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YGL217CYGL217C 342 nt1.16□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 HIT1YJR055W 495 nt1.16□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 PAC1YOR269W 1485 nt1.16□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 SLX4YLR135W 2247 nt1.15□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 PAU2YEL049W 363 nt1.15□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 STF2YGR008C 255 nt1.15□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 UPS1YLR193C 528 nt1.15□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 NUT2YPR168W 474 nt1.15□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 RAD50YNL250W 3939 nt1.15□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 NUP188YML103C 4968 nt1.14□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 AIM9YER080W 1884 nt1.14□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 MRPL31YKL138C 396 nt1.14□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 HUG1YML058W-A 207 nt1.14□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YOR121CYOR121C 306 nt1.14□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 RFX1YLR176C 2436 nt1.14□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 ENV11YGR071C 2583 nt1.13□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YPR117WYPR117W 7470 nt1.13□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YJR029WYJR029W 5268 nt1.13□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.13□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 snR14snR14 160 nt1.13□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YPL229WYPL229W 621 nt1.13□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YLL032CYLL032C 2478 nt1.13□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 RPL34BYIL052C 366 nt1.12□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 RPS27AYKL156W 249 nt1.12□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YLL020CYLL020C 306 nt1.12□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 ZIP1YDR285W 2628 nt1.12□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 CSN9YDR179C 489 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YJL135WYJL135W 318 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 SDH2YLL041C 801 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YLR334CYLR334C 381 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 PAU24YBR301W 363 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 EAF1YDR359C 2949 nt1.11□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YIL059CYIL059C 366 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YPL261CYPL261C 309 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 snR51snR51 107 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 EFR3YMR212C 2349 nt1.1□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 NUP145YGL092W 3954 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 APL1YJR005W 2103 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 SCC2YDR180W 4482 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 snR72snR72 98 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 IRC23YOR044W 474 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YPR012WYPR012W 255 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.09□□□□□ -2.23
CSI1Q04368 SWI6YLR182W 2412 nt1.09□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 PIG1YLR273C 1947 nt1.09□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 VAM6YDL077C 3150 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 SPT21YMR179W 2277 nt1.08□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 NOC3YLR002C 1992 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 RPS20YHL015W 366 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YAR053WYAR053W 297 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 APL3YBL037W 3078 nt1.07□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 HMRA1YCR097W 381 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YOR199WYOR199W 330 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 CDC39YCR093W 6327 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 DOP1YDR141C 5097 nt1.06□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 STB6YKL072W 2301 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 RPB10YOR210W 213 nt1.05□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YJR003CYJR003C 1560 nt1.04□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 SLD3YGL113W 2007 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 GIM4YEL003W 336 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YOL160WYOL160W 342 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 YBR012CYBR012C 420 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 OST1YJL002C 1431 nt1.03□□□□□ -2.24
CSI1Q04368 SCW11YGL028C 1629 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 YGR035CYGR035C 351 nt1.02□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 ZIP2YGL249W 2115 nt1.01□□□□□ -2.25
CSI1Q04368 KAP120YPL125W 3099 nt1.01□□□□□ -2.25
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