Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 UFD2YDL190C 2886 nt1.6□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 COG4YPR105C 2586 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 YHL041WYHL041W 450 nt1.59□□□□□ -2.15
SYF1Q04048 TRM732YMR259C 4263 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 PIG1YLR273C 1947 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 PAC1YOR269W 1485 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 SPC98YNL126W 2541 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 CYC7YEL039C 342 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 PET127YOR017W 2403 nt1.58□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 PAU2YEL049W 363 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YLR140WYLR140W 327 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YNL058CYNL058C 951 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YOR376WYOR376W 369 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 NUT1YGL151W 3399 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 CLU1YMR012W 3834 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 SPC110YDR356W 2835 nt1.57□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 MSN5YDR335W 3675 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 MVP1YMR004W 1536 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 EST2YLR318W 2655 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.56□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 ENV11YGR071C 2583 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 MUK1YPL070W 1839 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 NUT2YPR168W 474 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YLL032CYLL032C 2478 nt1.55□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 SRP14YDL092W 441 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 RPB10YOR210W 213 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 FYV8YGR196C 2454 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 SAS3YBL052C 2496 nt1.54□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 SEC5YDR166C 2916 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 POL5YEL055C 3069 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YJL015CYJL015C 285 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 UPS1YLR193C 528 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 SGO1YOR073W 1773 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 TIM18YOR297C 579 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 CDC25YLR310C 4770 nt1.53□□□□□ -2.16
SYF1Q04048 NOC3YLR002C 1992 nt1.52□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 RAD50YNL250W 3939 nt1.52□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 MRPL31YKL138C 396 nt1.52□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 VPS54YDR027C 2670 nt1.52□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YGL217CYGL217C 342 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 snR51snR51 107 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YLL054CYLL054C 2532 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 SMC4YLR086W 4257 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 SPO75YLL005C 2607 nt1.51□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 RPS20YHL015W 366 nt1.5□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YSY6YBR162W-A 198 nt1.5□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 AZF1YOR113W 2745 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 HKR1YDR420W 5409 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 RIM20YOR275C 1986 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 Q0142Q0142 177 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.49□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 SLX4YLR135W 2247 nt1.48□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 PAU12YGR294W 363 nt1.48□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 PAU24YBR301W 363 nt1.48□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 SIP4YJL089W 2490 nt1.48□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 SDH2YLL041C 801 nt1.47□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 RPL38YLR325C 237 nt1.47□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.47□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 YLR419WYLR419W 4308 nt1.47□□□□□ -2.17
SYF1Q04048 INP2YMR163C 2118 nt1.46□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YDR426CYDR426C 378 nt1.46□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 PCC1YKR095W-A 267 nt1.46□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 RPS30BYOR182C 192 nt1.46□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 SWI4YER111C 3282 nt1.46□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.45□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.45□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.45□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 ZIP2YGL249W 2115 nt1.45□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 SEC21YNL287W 2808 nt1.44□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 CSN9YDR179C 489 nt1.44□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.44□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 ALY2YJL084C 3141 nt1.43□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YDL211CYDL211C 1119 nt1.43□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.43□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 SEC3YER008C 4011 nt1.43□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 snR72snR72 98 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 RRT15YLR162W-A 189 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 HTB2YBL002W 396 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YOR199WYOR199W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 MAD1YGL086W 2250 nt1.42□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 BUD3YCL014W 4911 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 SPT21YMR179W 2277 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 RPL35AYDL191W 363 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YJL135WYJL135W 318 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YAF9YNL107W 681 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 RSM22YKL155C 1887 nt1.41□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 SCW11YGL028C 1629 nt1.4□□□□□ -2.18
SYF1Q04048 YKL136WYKL136W 399 nt1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms