Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPCQ03188 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPCQ03188 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPCQ03188 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPCQ03188 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPCQ03188 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPCQ03188 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPCQ03188 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms