Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms