Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB1Q02641 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB1Q02641 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms