Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms