Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT76Q01546 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT76Q01546 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms