Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX3Q00994 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms