Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
IRF9Q00978 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms