Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLTCQ00610 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTCQ00610 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms