Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDLBPQ00341 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDLBPQ00341 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms