Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCNA1P78396 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms