Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms