Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1P60507 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1P60507 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1P60507 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1P60507 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms