Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDL3P58872 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDL3P58872 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms