Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LOXL3P58215 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms