Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CABP4P57796 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CABP4P57796 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CABP4P57796 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CABP4P57796 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CABP4P57796 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms