Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3AP57075 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms