Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK1P57059 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SIK1P57059 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK1P57059 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK1P57059 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK1P57059 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK1P57059 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms