Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms