Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB3P54284 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms