Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-5P52952 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms