Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A2P52657 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms