Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND2P52198 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND2P52198 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND2P52198 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND2P52198 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RND2P52198 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms