Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RAB5CP51148 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RAB5CP51148 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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