Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSEN2P49810 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms