Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRIM1P49642 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRIM1P49642 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms