Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK8P49336 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK8P49336 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK8P49336 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK8P49336 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK8P49336 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms