Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NESP48681 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NESP48681 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NESP48681 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NESP48681 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NESP48681 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NESP48681 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NESP48681 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NESP48681 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NESP48681 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NESP48681 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NESP48681 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NESP48681 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NESP48681 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NESP48681 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NESP48681 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NESP48681 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NESP48681 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NESP48681 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NESP48681 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NESP48681 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NESP48681 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NESP48681 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NESP48681 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NESP48681 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NESP48681 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NESP48681 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NESP48681 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NESP48681 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NESP48681 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NESP48681 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NESP48681 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms