Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP1P48552 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP1P48552 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP1P48552 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP1P48552 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms