Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX5P48382 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RFX5P48382 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFX5P48382 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX5P48382 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX5P48382 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms