Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA8P48165 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA8P48165 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA8P48165 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA8P48165 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA8P48165 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA8P48165 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJA8P48165 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA8P48165 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA8P48165 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA8P48165 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms