Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ME1P48163 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ME1P48163 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ME1P48163 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ME1P48163 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ME1P48163 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms