Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIA4P48058 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms