Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL35P42766 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms