Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ECI1P42126 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECI1P42126 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECI1P42126 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms