Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms