Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PBX2P40425 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PBX2P40425 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBX2P40425 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBX2P40425 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PBX2P40425 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PBX2P40425 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PBX2P40425 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PBX2P40425 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms