Protein–RNA interactions for Protein: P38873

KOG1, Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KOG1P38873 CUL3YGR003W 2235 nt-0.73□□□□□ -2.53
KOG1P38873 GOS1YHL031C 672 nt-0.74□□□□□ -2.53
KOG1P38873 BET4YJL031C 984 nt-0.74□□□□□ -2.53
KOG1P38873 RPS7BYNL096C 573 nt-0.74□□□□□ -2.53
KOG1P38873 CDC33YOL139C 642 nt-0.76□□□□□ -2.53
KOG1P38873 YOL118CYOL118C 309 nt-0.77□□□□□ -2.53
KOG1P38873 VPS28YPL065W 729 nt-0.77□□□□□ -2.53
KOG1P38873 COY1YKL179C 2040 nt-0.77□□□□□ -2.53
KOG1P38873 YKU70YMR284W 1809 nt-0.77□□□□□ -2.53
KOG1P38873 NIP1YMR309C 2439 nt-0.78□□□□□ -2.53
KOG1P38873 OST4YDL232W 111 nt-0.79□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt-0.79□□□□□ -2.54
KOG1P38873 GIM5YML094W 492 nt-0.79□□□□□ -2.54
KOG1P38873 RFX1YLR176C 2436 nt-0.79□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YFR057WYFR057W 456 nt-0.79□□□□□ -2.54
KOG1P38873 GPG1YGL121C 381 nt-0.79□□□□□ -2.54
KOG1P38873 NUP82YJL061W 2142 nt-0.8□□□□□ -2.54
KOG1P38873 MCM10YIL150C 1716 nt-0.81□□□□□ -2.54
KOG1P38873 NFU1YKL040C 771 nt-0.81□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YNL146WYNL146W 303 nt-0.81□□□□□ -2.54
KOG1P38873 PRP21YJL203W 843 nt-0.82□□□□□ -2.54
KOG1P38873 ECM9YKR004C 1134 nt-0.82□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.82□□□□□ -2.54
KOG1P38873 ARV1YLR242C 966 nt-0.82□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.83□□□□□ -2.54
KOG1P38873 SMD2YLR275W 333 nt-0.83□□□□□ -2.54
KOG1P38873 HTB1YDR224C 396 nt-0.83□□□□□ -2.54
KOG1P38873 MMS21YEL019C 804 nt-0.83□□□□□ -2.54
KOG1P38873 HTB2YBL002W 396 nt-0.83□□□□□ -2.54
KOG1P38873 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.84□□□□□ -2.54
KOG1P38873 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
KOG1P38873 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
KOG1P38873 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.84□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.84□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt-0.84□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YPL044CYPL044C 549 nt-0.84□□□□□ -2.54
KOG1P38873 DIE2YGR227W 1578 nt-0.85□□□□□ -2.54
KOG1P38873 YCR022CYCR022C 345 nt-0.85□□□□□ -2.55
KOG1P38873 COG6YNL041C 2520 nt-0.85□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YDL068WYDL068W 330 nt-0.86□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.87□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YDL152WYDL152W 366 nt-0.87□□□□□ -2.55
KOG1P38873 AFB1YLR040C 675 nt-0.87□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YGL204CYGL204C 306 nt-0.88□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.88□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YBR064WYBR064W 429 nt-0.89□□□□□ -2.55
KOG1P38873 RMD6YEL072W 696 nt-0.9□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.91□□□□□ -2.55
KOG1P38873 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.91□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YPL185WYPL185W 396 nt-0.91□□□□□ -2.56
KOG1P38873 BI3Q0115 1554 nt-0.92□□□□□ -2.56
KOG1P38873 snR33snR33 183 nt-0.92□□□□□ -2.56
KOG1P38873 TDA2YER071C 381 nt-0.93□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.93□□□□□ -2.56
KOG1P38873 ATP20YPR020W 348 nt-0.94□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.95□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YPL205CYPL205C 345 nt-0.95□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YPR142CYPR142C 564 nt-0.95□□□□□ -2.56
KOG1P38873 MRPL31YKL138C 396 nt-0.96□□□□□ -2.56
KOG1P38873 MFA2YNL145W 117 nt-0.96□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YDR008CYDR008C 351 nt-0.96□□□□□ -2.56
KOG1P38873 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.96□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YGL042CYGL042C 306 nt-0.96□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YJR079WYJR079W 330 nt-0.96□□□□□ -2.56
KOG1P38873 YOR345CYOR345C 351 nt-0.96□□□□□ -2.56
KOG1P38873 TFB6YOR352W 1032 nt-0.98□□□□□ -2.57
KOG1P38873 BI4Q0120 1917 nt-0.98□□□□□ -2.57
KOG1P38873 snR24snR24 89 nt-0.99□□□□□ -2.57
KOG1P38873 snR36snR36 182 nt-0.99□□□□□ -2.57
KOG1P38873 RUB1YDR139C 234 nt-1□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-1□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YJL120WYJL120W 324 nt-1□□□□□ -2.57
KOG1P38873 CMS1YLR003C 876 nt-1□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-1□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YPR099CYPR099C 357 nt-1.01□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YLR271WYLR271W 825 nt-1.02□□□□□ -2.57
KOG1P38873 GSP1YLR293C 660 nt-1.02□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-1.03□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-1.03□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-1.03□□□□□ -2.57
KOG1P38873 YPR096CYPR096C 303 nt-1.03□□□□□ -2.57
KOG1P38873 SUS1YBR111W-A 291 nt-1.04□□□□□ -2.58
KOG1P38873 snR44snR44 211 nt-1.04□□□□□ -2.58
KOG1P38873 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-1.04□□□□□ -2.58
KOG1P38873 SEM1YDR363W-A 270 nt-1.04□□□□□ -2.58
KOG1P38873 YER158W-AYER158W-A 216 nt-1.04□□□□□ -2.58
KOG1P38873 YJL086CYJL086C 369 nt-1.04□□□□□ -2.58
KOG1P38873 PAN3YKL025C 2040 nt-1.05□□□□□ -2.58
KOG1P38873 snR79snR79 84 nt-1.06□□□□□ -2.58
KOG1P38873 ATC1YDR184C 885 nt-1.06□□□□□ -2.58
KOG1P38873 LSM4YER112W 564 nt-1.06□□□□□ -2.58
KOG1P38873 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-1.06□□□□□ -2.58
KOG1P38873 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-1.06□□□□□ -2.58
KOG1P38873 PET20YPL159C 762 nt-1.06□□□□□ -2.58
KOG1P38873 PSF2YJL072C 642 nt-1.08□□□□□ -2.58
KOG1P38873 ZIP2YGL249W 2115 nt-1.08□□□□□ -2.58
KOG1P38873 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-1.08□□□□□ -2.58
KOG1P38873 IPP1YBR011C 864 nt-1.08□□□□□ -2.58
KOG1P38873 RSM23YGL129C 1353 nt-1.09□□□□□ -2.58
KOG1P38873 YER076W-AYER076W-A 348 nt-1.09□□□□□ -2.58
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