Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGCXP38435 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GGCXP38435 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GGCXP38435 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGCXP38435 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGCXP38435 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGCXP38435 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms